211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1315 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  100 
 
 
402 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  93.28 
 
 
402 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  99.75 
 
 
402 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  98.01 
 
 
402 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  69.4 
 
 
402 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  69.4 
 
 
402 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  69.4 
 
 
402 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  68.16 
 
 
402 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  67.41 
 
 
402 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  67.66 
 
 
402 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 
397 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  40.2 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
397 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  40.92 
 
 
397 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  39.49 
 
 
397 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  36.63 
 
 
400 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  37.22 
 
 
400 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  36.72 
 
 
400 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  35.98 
 
 
400 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  33.96 
 
 
412 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  33.69 
 
 
387 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  36.71 
 
 
383 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 
391 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.64 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.82 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.82 
 
 
381 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.4 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.7 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.4 
 
 
376 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.38 
 
 
416 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  29.6 
 
 
420 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.97 
 
 
377 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  21.76 
 
 
412 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.66 
 
 
377 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.62 
 
 
389 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
430 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.32 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
430 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  27.14 
 
 
414 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.96 
 
 
419 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.5 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.43 
 
 
373 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.24 
 
 
398 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.87 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.71 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.08 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  23.41 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.69 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.2 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.99 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.54 
 
 
580 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  26.91 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  28.83 
 
 
587 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.57 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.54 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.53 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.23 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  27.39 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  24.93 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.03 
 
 
537 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.72 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.32 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.02 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.28 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.65 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  25 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  28.74 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.49 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  25.81 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  24.62 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  24.58 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.67 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  22.78 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.35 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  27.74 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.18 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  23.73 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  24.31 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  24.58 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  21.17 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.93 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  20.85 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.07 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.7 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  27.23 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  22.7 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.78 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.36 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  24.9 
 
 
439 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  26.07 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  21.18 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  22.01 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  26.92 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.92 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.36 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.1 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  23.03 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>