157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1404 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  100 
 
 		 426 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  74.53 
 
 		 424 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  75.7 
 
 		 424 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  72.9 
 
 		 412 aa  577  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  72.66 
 
 		 412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  72.66 
 
 		 412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  72.66 
 
 		 412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  72.66 
 
 		 412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  72.66 
 
 		 412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  71.97 
 
 		 405 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  71.97 
 
 		 405 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  70.33 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  69.39 
 
 		 412 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  69.39 
 
 		 412 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  69.39 
 
 		 412 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  63.4 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  63.26 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  43.48 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  41.87 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  41.87 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  41.9 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  45.03 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  40.92 
 
 		 508 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  36.52 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  30.84 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  29.74 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  28.76 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  28.76 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  27.41 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  28.79 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  27.97 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  28.21 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.19 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.89 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  27.3 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.61 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.25 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  28.25 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.03 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.44 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.73 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.55 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.39 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.83 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25.26 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  27.96 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.56 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.52 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.97 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.25 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  22.91 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  22.19 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.78 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.01 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.13 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.27 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.9 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  29.96 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.52 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  21.71 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  21.83 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  22.59 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  23.01 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.39 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.54 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  21.38 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  24.04 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  23.38 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  24.01 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.35 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  26.16 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.24 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  25.88 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  25.88 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.24 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.24 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  22.4 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  23.34 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  23.93 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>