More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1726 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  100 
 
 		 414 aa  849    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.76 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.32 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 389 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.63 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.84 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.36 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.78 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  22.98 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.03 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  27.46 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  32.24 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  30 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  28.46 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  28.46 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  24.38 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.8 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  27.8 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.72 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.94 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.6 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.57 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  29.19 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25.63 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.95 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  23.29 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.27 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.32 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  23.64 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.91 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.35 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  22.32 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  22.32 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  20.47 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  22.63 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.36 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.85 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.33 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  21.91 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  23.37 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  23 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.53 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  22.78 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  22.78 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  22.78 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  22.57 
 
 		 587 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.81 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.43 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  27.9 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  22.05 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  27.75 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.3 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.95 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  22.68 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  23.93 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  21.71 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.24 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  25.28 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  25.28 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  25.28 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  25.28 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  25.28 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  25.28 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  25.28 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  24.91 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  27.51 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  21 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  27.22 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  22.26 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  25.84 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  28.33 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  25.95 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  21.22 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  25.65 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  21.92 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  21.87 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  23.64 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  21.57 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  21.28 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>