More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2115 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  100 
 
 		 412 aa  834    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  43.41 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  41.45 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  38.86 
 
 		 430 aa  286  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  30.31 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  30.87 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  30.45 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.97 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  28.53 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 373 aa  150  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.2 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  29.19 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  32.03 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.55 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  27.98 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.08 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  29.08 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.54 
 
 		 399 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.17 
 
 		 389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.6 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  26.11 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.36 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.3 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.39 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.91 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  25.42 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  32.34 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.21 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.93 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 216 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.98 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.67 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.52 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.1 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 		 209 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 216 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  25.15 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  23.14 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 216 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 215 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 217 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 200 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 216 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  45 
 
 		 232 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  45 
 
 		 232 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 224 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 237 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.7 
 
 		 205 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 237 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  21.76 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.62 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.56 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.22 
 
 		 222 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  21.76 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 216 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 201 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 220 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 234 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.5 
 
 		 204 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 201 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  21.27 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 217 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.98 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 217 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 201 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 224 aa  100  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 224 aa  100  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  34.05 
 
 		 214 aa  99.8  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 201 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 213 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  25.5 
 
 		 422 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 223 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>