More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2638 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  100 
 
 
401 aa  811    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  64.09 
 
 
399 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  59.06 
 
 
398 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  57.61 
 
 
398 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.44 
 
 
391 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  48.79 
 
 
407 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  36.18 
 
 
395 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  36.39 
 
 
397 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.02 
 
 
423 aa  170  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  29.79 
 
 
392 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.34 
 
 
430 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  29.59 
 
 
430 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  29.83 
 
 
417 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  29.08 
 
 
412 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  28.84 
 
 
416 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  28.75 
 
 
392 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  31.97 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  30.16 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.89 
 
 
390 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  31.51 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  26.49 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  30.56 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
373 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  30.34 
 
 
373 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 
391 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  26.2 
 
 
387 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  28.66 
 
 
406 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.43 
 
 
377 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  29.32 
 
 
419 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  26.79 
 
 
402 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24.27 
 
 
373 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.8 
 
 
414 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.39 
 
 
404 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.57 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  25.34 
 
 
397 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.49 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  22.94 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  26.25 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.06 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25.5 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.57 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  30.89 
 
 
537 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.84 
 
 
400 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.08 
 
 
389 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.54 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  27.2 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  27.2 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  27.2 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  27.2 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  27.2 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.48 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  27.2 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.7 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  27.2 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  25.61 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.58 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  27.2 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.78 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  22.19 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  26.32 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  28.4 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.44 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.35 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.35 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  26.65 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  27.39 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  27.39 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  27.39 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  27.8 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  29.13 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  26.67 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.7 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  26.38 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  24.73 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  29.11 
 
 
269 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  28.09 
 
 
269 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  27.72 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01150  membrane ATPase of the MinC-MinD-MinE system  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01160  hypothetical protein  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.79 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1275  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000562763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1974  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102785  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004087  septum site-determining protein MinD  27.97 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000729512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  27.34 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  25 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  25.98 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  27.34 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  28.39 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  25.85 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  28.96 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  26.69 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>