157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1522 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  96.12 
 
 		 412 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  100 
 
 		 412 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  100 
 
 		 412 aa  809    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  100 
 
 		 412 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  69.1 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  74.33 
 
 		 412 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  73.12 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  73.12 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  73.12 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  73.12 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  73.12 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  70.09 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  72.66 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  72.66 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  67.92 
 
 		 424 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  67.07 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  66.59 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  44.95 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  43.99 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  43.99 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  42.53 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  43.47 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  38.95 
 
 		 508 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  41.18 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  30.65 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  28.84 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  28.08 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  30.77 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  30.5 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  28.66 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  29.16 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  29.16 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  26.91 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  26.91 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.88 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.62 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.62 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  19.76 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 373 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.91 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.71 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.97 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  26.85 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.76 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.65 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.11 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.56 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.48 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  27.39 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.27 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  21.97 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.05 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.73 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.99 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  25.78 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20.94 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  20.86 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  25.47 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  28.62 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.72 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  21.6 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.86 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.08 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.32 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  25.32 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.06 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  26.73 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  24.53 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.83 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.73 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  26.99 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  25.62 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.29 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.92 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  23.2 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  27.21 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  22.02 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  27.07 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  27.07 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  24.84 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>