More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2272 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  100 
 
 
537 aa  1070    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  35.86 
 
 
524 aa  277  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.25 
 
 
376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  29.12 
 
 
389 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  29.12 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  29.19 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  35.37 
 
 
390 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.82 
 
 
377 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  28.79 
 
 
430 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
392 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.77 
 
 
389 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.3 
 
 
430 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  28.11 
 
 
413 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  31.38 
 
 
397 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.31 
 
 
392 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.44 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.39 
 
 
377 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  30.18 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  28.64 
 
 
373 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  28.94 
 
 
417 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  27.45 
 
 
416 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  26.04 
 
 
412 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.28 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.28 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.5 
 
 
444 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.43 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  30.89 
 
 
401 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  27.85 
 
 
391 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.65 
 
 
399 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  26.78 
 
 
373 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.78 
 
 
373 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  28.4 
 
 
391 aa  87.8  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  32.18 
 
 
264 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.7 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.11 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.15 
 
 
398 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  27.17 
 
 
266 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  31.49 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.22 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  29.03 
 
 
267 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.75 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  26.03 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  27.78 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  27.78 
 
 
265 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  27.22 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  27.22 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  27.78 
 
 
265 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  27.78 
 
 
265 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  26.14 
 
 
273 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  29.02 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  26.67 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.56 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  28.03 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 
265 aa  77  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  28.03 
 
 
402 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  28.03 
 
 
402 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  29.15 
 
 
266 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.51 
 
 
414 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  26.72 
 
 
265 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  26.72 
 
 
265 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  26.02 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.45 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.63 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  26.97 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  27.01 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  28.07 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  27.87 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  25.95 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
402 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  28.22 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.59 
 
 
265 aa  73.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  26.46 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  26.21 
 
 
405 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.61 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  26.38 
 
 
271 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  26.8 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.05 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0536  chromosome partitioning ATPase  30.41 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.605125  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.98 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  28.24 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.76 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.58 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  33.72 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  28.24 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  25.12 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.57 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.35 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  28.41 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  24.87 
 
 
264 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>