More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0589 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  100 
 
 		 402 aa  821    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  50.38 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  41.16 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  40.2 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  40.2 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  39.69 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  41.08 
 
 		 400 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  38.32 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  41.16 
 
 		 402 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 402 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  42.54 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  37.56 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  36.32 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  36.32 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  32.07 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  28.48 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.62 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.9 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.79 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.83 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  23.1 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  22 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  26.26 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  24.64 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.38 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.07 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.46 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  22.67 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.98 
 
 		 587 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.53 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  24.18 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  23 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  25.76 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  21.38 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  22.76 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  22.53 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  25.76 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.24 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  22.58 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.95 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23.83 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.44 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.48 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  23.34 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.08 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.78 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  21.12 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.59 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.45 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  26.25 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  23.59 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  23.26 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  23.06 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  28.63 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.41 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.9 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  23.79 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  25.42 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.74 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  25.1 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  23.42 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  22.33 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  24.69 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  22.59 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  25.09 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.17 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  22.85 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  26.28 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  23.36 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  23.79 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.37 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  21.93 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.96 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.76 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  24.33 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  23.61 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.69 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  23.28 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  26.4 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>