More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4612 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  100 
 
 		 417 aa  847    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  63.94 
 
 		 430 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  62.02 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  59.28 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  39.73 
 
 		 392 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  34.24 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  34.01 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  30 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  31.64 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  34.92 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  30.62 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  33.54 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  30.79 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  33.44 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  29.83 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.78 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.22 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  24.27 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.31 
 
 		 377 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.05 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  27.67 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  29.17 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.83 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.27 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  28.39 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.97 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  28.24 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.52 
 
 		 382 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.92 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.18 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.17 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 237 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.94 
 
 		 537 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.87 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.87 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.54 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.86 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 216 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  47.97 
 
 		 234 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 216 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.77 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.84 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.41 
 
 		 222 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 215 aa  99.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 212 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 217 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.3 
 
 		 201 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 222 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 216 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.2 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 201 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 238 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 224 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 253 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.12 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 229 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 218 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  38.66 
 
 		 220 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 211 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 250 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.3 
 
 		 219 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 218 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.43 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 217 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 216 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 215 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 201 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 216 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 218 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 233 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 218 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.33 
 
 		 215 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 212 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 213 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.65 
 
 		 242 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.4 
 
 		 228 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>