More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0798 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 391 aa  788    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  44.13 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  39.14 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  36.81 
 
 		 397 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  36.52 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  35.36 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  36.52 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  35.36 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  36.96 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  36.42 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  35.22 
 
 		 402 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  35.91 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  36.31 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  33.82 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  32.44 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  33.14 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.96 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  29.94 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  31.81 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.14 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.88 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.46 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 373 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  28.82 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.26 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  33.94 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  28.31 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.11 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.55 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.47 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.98 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.54 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.75 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.85 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.81 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.43 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  30.77 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  28.21 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 419 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.08 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.15 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  27.02 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  26.93 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.15 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.15 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.45 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.46 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  26.86 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.4 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  26.54 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  26.17 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  26.4 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  26.4 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.63 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  26.4 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.16 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.64 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  25.76 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  26.79 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  26.07 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.39 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  25.57 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.39 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  23.62 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  25.9 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.73 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  26.3 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.33 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>