More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4616 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  100 
 
 		 400 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  72.25 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  71.5 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  63.75 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  46.13 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  41.16 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  41.08 
 
 		 402 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  40.45 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  39.95 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 402 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  37.47 
 
 		 402 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  37.22 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  37.22 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 402 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  36.97 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  35.57 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  33.97 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  33.82 
 
 		 391 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.04 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.91 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  31.12 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.96 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.4 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  29.04 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  25.37 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.18 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.65 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.83 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  25.91 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  27.71 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.05 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.18 
 
 		 377 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.07 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  27.25 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.88 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.85 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.44 
 
 		 413 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.62 
 
 		 395 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.84 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.94 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  22.43 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  24.64 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  27.3 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.97 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.19 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.4 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.27 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.22 
 
 		 537 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  25.66 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  21.91 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.66 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.29 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  25.33 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  29.44 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  21.92 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  23.92 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  28.46 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  28.46 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  24.74 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.38 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  24.43 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  22.74 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  24.06 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.69 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.31 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  24.59 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.27 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  27.38 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  24.31 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  27.49 
 
 		 257 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  23.46 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  27.09 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>