246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3655 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  100 
 
 		 412 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  64.35 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  56.75 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  54.99 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  54.99 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  45.61 
 
 		 413 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  45.77 
 
 		 413 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  44.15 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  44.15 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  44.15 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  42.9 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  42.9 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  42.9 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  43.16 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  42.48 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  42.9 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  42.9 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  42.48 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  43.65 
 
 		 412 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  36.02 
 
 		 508 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  32.87 
 
 		 409 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  32.87 
 
 		 409 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  36.31 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  29.92 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  28.53 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  33.69 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  29.14 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  28.88 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  27.78 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  27.44 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  27.22 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.01 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 404 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.77 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.66 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.93 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.45 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.17 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.01 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.14 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  21.94 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  22.51 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.46 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  22.46 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.7 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.18 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.29 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.06 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.02 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.88 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.4 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.08 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.09 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  29.77 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  21.56 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  24.16 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.1 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.49 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  28.84 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.15 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  29.84 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  29.84 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  27.74 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  24.08 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.59 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.36 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  26.59 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.55 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  25.89 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  25.84 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.22 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  26.2 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  23.87 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.89 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  24.43 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  27.17 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>