223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1527 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  100 
 
 		 383 aa  767    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  43.56 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  41.89 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  39.14 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  38.63 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  36.71 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  36.71 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  36.71 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  36.71 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  37.09 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  34.37 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  33.42 
 
 		 397 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 397 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  34.4 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  35.29 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  35.4 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  35.1 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  31.72 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.01 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.39 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  30.31 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  29.18 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.01 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  26.33 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  26.74 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.64 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.58 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  32.15 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 419 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  25.63 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.94 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.52 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.34 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.58 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 417 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.4 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  29.08 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.21 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.69 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.07 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.7 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.69 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  22.94 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.67 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  25.78 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  28.76 
 
 		 422 aa  93.2  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 435 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  26.06 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 423 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.03 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.06 
 
 		 528 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 524 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.4 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  26.5 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.55 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  24.62 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.27 
 
 		 580 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.16 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  26.99 
 
 		 587 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  22.99 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  26.41 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  24.32 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.4 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  24.44 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  25.09 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.55 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  25.65 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  24.67 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  30.96 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  24.84 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  24.37 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.78 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>