240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0725 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  100 
 
 
428 aa  871    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  61.41 
 
 
422 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  58.31 
 
 
428 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  59.06 
 
 
425 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  57.07 
 
 
428 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  58.01 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  52.5 
 
 
414 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  50.94 
 
 
423 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  52.24 
 
 
422 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  51.6 
 
 
421 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  51.99 
 
 
425 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  50.84 
 
 
422 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  49.65 
 
 
425 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  51 
 
 
423 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  51.99 
 
 
414 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  52 
 
 
414 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  51.87 
 
 
414 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  51.87 
 
 
414 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  49.4 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  48.88 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  48.73 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  47.72 
 
 
493 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  46.28 
 
 
422 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  47.79 
 
 
423 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  42.64 
 
 
580 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  43.32 
 
 
587 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.02 
 
 
422 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.87 
 
 
424 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  28.53 
 
 
422 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  28.29 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  28.29 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  28.29 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  28.29 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  28.29 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  28.29 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  27.95 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.42 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  25.97 
 
 
389 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  27.15 
 
 
407 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  31.43 
 
 
400 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.88 
 
 
412 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.56 
 
 
415 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.96 
 
 
377 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  29.3 
 
 
401 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.09 
 
 
444 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.28 
 
 
406 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  26.14 
 
 
416 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  27.88 
 
 
413 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.03 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  29.93 
 
 
399 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  22.87 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  26.25 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  26.07 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.75 
 
 
397 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.47 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25.07 
 
 
389 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.44 
 
 
377 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  24.8 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.75 
 
 
392 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.91 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.91 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  27.57 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.05 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  24.33 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.34 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  23.65 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  23.41 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.91 
 
 
395 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.66 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  23.41 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.92 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  26.16 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  26.16 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.74 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.62 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.52 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.82 
 
 
408 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.77 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.26 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.35 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.74 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  24.07 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.57 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  25.09 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.54 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.61 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20.88 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.25 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  23.55 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.16 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.17 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  25.84 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  24.62 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.02 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.08 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  25.47 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  22.89 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>