244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1127 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  100 
 
 		 435 aa  868    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  52.17 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  51.69 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  51.31 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  50.84 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  49.39 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.99 
 
 		 387 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.1 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.54 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 389 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.84 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24.6 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.97 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.1 
 
 		 392 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.06 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.49 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.28 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.82 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.93 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  26.69 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.94 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.06 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.3 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.24 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.24 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.2 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  22.39 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.22 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.85 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.61 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.73 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  25 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  24.43 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  23.6 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  21.86 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.23 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  21.18 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  25.75 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  21.18 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  21.18 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.72 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  23.6 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.11 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  25.38 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  23.56 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  24.69 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.62 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  20.12 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.34 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20.64 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  25.97 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.53 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  25.94 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.11 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.62 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  24.23 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.74 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.26 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.91 
 
 		 528 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  25.57 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.75 
 
 		 580 aa  56.6  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  25.93 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03531  putative septum site-determining protein MinD  28.34 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.43 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  24.15 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  24.39 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  25.55 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  25.55 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  24.84 
 
 		 524 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  28.33 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.78 
 
 		 284 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  28.82 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.3 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>