129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1521 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  100 
 
 		 398 aa  797    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  29.94 
 
 		 423 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  28.24 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  27.03 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  28.37 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.73 
 
 		 425 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.33 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  27.1 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  26.64 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.4 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  29.28 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  27.37 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.18 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  24.09 
 
 		 419 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  29.39 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.95 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  27.31 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.38 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  27.38 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.38 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.69 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  27.06 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.35 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  22.88 
 
 		 580 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.28 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.09 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  23.33 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.47 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  25.73 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.46 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.26 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  24.46 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.12 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  27.43 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  32.87 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.58 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  23.28 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  23.23 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.38 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.9 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.02 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  33.72 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.83 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  28.19 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  25.29 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.26 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.12 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.77 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.3 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  24 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  27.21 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.57 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.76 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.4 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.32 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.5 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  24.63 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.99 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  27.67 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.97 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.6 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.6 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.45 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  23 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.64 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  22.92 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.89 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.49 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  25 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>