263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2055 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
415 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  85.5 
 
 
407 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  85.75 
 
 
407 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  53.45 
 
 
405 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  53.08 
 
 
411 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  53.08 
 
 
411 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  53.08 
 
 
411 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  53.08 
 
 
411 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  53.08 
 
 
411 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  53.08 
 
 
411 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  32.07 
 
 
400 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  32.01 
 
 
389 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  27.3 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
422 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  31.29 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  29.77 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  26.77 
 
 
580 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  28.86 
 
 
422 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  30.62 
 
 
528 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  26.49 
 
 
422 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  32.54 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
587 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.32 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  31.18 
 
 
399 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  26.92 
 
 
422 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.35 
 
 
400 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  27.22 
 
 
425 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  28.24 
 
 
423 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  28.07 
 
 
425 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  27.43 
 
 
423 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  31.43 
 
 
403 aa  106  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.56 
 
 
428 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  26.43 
 
 
423 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  27.32 
 
 
414 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  26.35 
 
 
414 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.14 
 
 
414 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  26.06 
 
 
414 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  30.39 
 
 
493 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  29.07 
 
 
428 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  25.68 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  25.97 
 
 
428 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  25.47 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  26.23 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  24.84 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.87 
 
 
422 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  25.52 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  25.56 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  24.5 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  27.3 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.3 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  25.55 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.3 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  21.38 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.19 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.48 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.72 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  28.38 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  24.86 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.31 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.6 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.08 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.42 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  24.12 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  23.05 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.7 
 
 
537 aa  69.7  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.54 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.89 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.43 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  21.6 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.07 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.07 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  25.87 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  21.49 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  23.65 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.06 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  27.2 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24 
 
 
373 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.82 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.31 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 
272 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.72 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.74 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.33 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  23.28 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.44 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.06 
 
 
390 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.6 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  22.32 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  22.07 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.34 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.75 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2458  chromosome partitioning ATPase  25.75 
 
 
498 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.23 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.14 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.19 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.27 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  28.57 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  25.11 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>