269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1907 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  100 
 
 		 423 aa  853    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  88.39 
 
 		 423 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  99.29 
 
 		 423 aa  846    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  57.07 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  51.93 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.22 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  28.35 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.48 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  19.94 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.38 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.36 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.62 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  27.37 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  25.42 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.55 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.62 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.6 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.94 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.14 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.58 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 587 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.15 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  22.4 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  20.58 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  21.15 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.72 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.87 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.69 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.06 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.58 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  21.58 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.58 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.45 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.22 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.68 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.43 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  24.34 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  28.09 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  25.98 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  24.57 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  26.1 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.43 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.74 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.92 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.7 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  31 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.18 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.17 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  25.54 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.28 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  23.91 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.42 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  26.39 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  25.36 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  27.17 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  23.92 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  24.56 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  24.35 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  19.69 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  25.29 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.51 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.21 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  24.6 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  23.84 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>