More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2829 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  100 
 
 		 414 aa  826    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  88.41 
 
 		 414 aa  722    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  69.32 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  69.32 
 
 		 414 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  64.73 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  61.25 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  61.5 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  60.64 
 
 		 421 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  61.96 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  61.44 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  61.75 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  62.09 
 
 		 422 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  52.87 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  53.69 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  51.01 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  54.74 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  50.63 
 
 		 528 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  49.51 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  49.48 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  48.56 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  48.97 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  47.88 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  41.71 
 
 		 580 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  40.7 
 
 		 587 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  32.21 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  31.38 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  31.95 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  30.56 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  30.56 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  30.56 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  30.56 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  30.56 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  30.56 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 389 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.4 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  28.62 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  26.63 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.68 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  28 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.06 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  27.14 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  27.14 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  27.56 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.96 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.24 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.86 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.34 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.5 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.35 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.63 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.63 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.55 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.64 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.18 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  26.43 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  24.92 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.14 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.14 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.11 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  24.6 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  24.6 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  24.6 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  24.6 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  24.6 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.12 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  24.6 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  24.6 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.52 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  27.52 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  25.28 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  25 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.3 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.91 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.16 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.88 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.09 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>