201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4478 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  95.29 
 
 		 425 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  100 
 
 		 425 aa  867    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  72.17 
 
 		 428 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  71.03 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  59.06 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  51.53 
 
 		 421 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  51.51 
 
 		 422 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  51.01 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  50.5 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  48.93 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  49.53 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  49.48 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  51.53 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  50.37 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  50 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  48.73 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  48.45 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  48.73 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  48.73 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  46.7 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  45.94 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  47.13 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  40.4 
 
 		 580 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  39.85 
 
 		 587 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.63 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.65 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  26.26 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  26.93 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  26.93 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  26.93 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  26.93 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  26.93 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  26.93 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  28.1 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.48 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  30.29 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.32 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.05 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.85 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.85 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.55 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  25.5 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  22.61 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  21.82 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  25 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  21.45 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.07 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  23.83 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.69 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.35 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  23.56 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.38 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.09 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  20.44 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.24 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  23.21 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  20.73 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  20.94 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.47 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.3 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  21.43 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.65 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.05 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.55 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.72 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.65 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.09 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  23.28 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  23.28 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.57 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.82 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.53 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  22.27 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  24.3 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  24.22 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.26 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.15 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  24.01 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  24.01 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  24.01 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  22.61 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  23.08 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  21.48 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>