269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3715 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  82.98 
 
 		 421 aa  731    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  86.59 
 
 		 425 aa  762    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  100 
 
 		 423 aa  861    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  85.88 
 
 		 425 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  86.52 
 
 		 422 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  85.82 
 
 		 422 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  85.82 
 
 		 423 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  66.9 
 
 		 422 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  61.25 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  58.52 
 
 		 414 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  60.95 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  59.55 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  58.56 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  58.56 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  51.5 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  51.19 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  49.87 
 
 		 493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  50.5 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  48.8 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  48.72 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  51.04 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  41.73 
 
 		 580 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  39.95 
 
 		 587 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.94 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  30.35 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 389 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  30.67 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  27.14 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  27.3 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.08 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  27.13 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  27.13 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  27.13 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  27.13 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  27.13 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  27.13 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.74 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.33 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  26.43 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.3 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.44 
 
 		 406 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  26.69 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.97 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.97 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.75 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.59 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.69 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  24.01 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.27 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  23.58 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  30.21 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.49 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.4 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.62 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.09 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  23.89 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.57 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.11 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  25 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  25 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.17 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.45 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  26.53 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.81 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.39 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.43 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  23.73 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  22.97 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  25.15 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.96 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  23.92 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.75 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1698  putative septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  25.61 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.75 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04131  putative septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 		 271 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0953852  normal  0.420174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  29.22 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24.28 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.9 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.99 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>