More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2355 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  840    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  47.09 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  37.05 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  33.96 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  33.96 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  33.96 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  36.98 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  32.62 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  33.25 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  33.25 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  33.42 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  33.97 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  32.66 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  32.07 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  33.51 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  34.22 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  33.95 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  30.34 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  33.72 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  32.57 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.53 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.29 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.83 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  33.33 
 
 		 377 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.72 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.34 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  32.53 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.64 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  29.14 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.16 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.84 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.93 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.97 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  29.37 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.73 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.85 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  25.63 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  26.88 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  25 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.38 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  27.68 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.96 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.57 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  26.14 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  25.43 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.61 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  23.17 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  23.48 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  23.48 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.6 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  25 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.45 
 
 		 395 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.86 
 
 		 528 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.38 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  23.55 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  26.04 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  24.5 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  23.24 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  24.67 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  24.85 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  23.74 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  23.89 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.71 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  23.14 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  22.62 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.95 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.51 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  22.74 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  26.61 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  26.61 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  23.86 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  21.54 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  27.87 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.47 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  21.56 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>