117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1641 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  100 
 
 
418 aa  850    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  31.44 
 
 
396 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  31.17 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  30.42 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  39.87 
 
 
394 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  39.55 
 
 
394 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  31.74 
 
 
406 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  30.39 
 
 
396 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  32.19 
 
 
412 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  29.65 
 
 
447 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  29.65 
 
 
447 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  28.07 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  30.32 
 
 
439 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.25 
 
 
426 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  29 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  26.48 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  28.4 
 
 
413 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  29.18 
 
 
412 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  28.74 
 
 
424 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  27.32 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  29.51 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  29.51 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  29.51 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  29.51 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  29.51 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  29.51 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  29.51 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  29.84 
 
 
412 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  29.05 
 
 
412 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  29.05 
 
 
412 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  29.05 
 
 
412 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.87 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  27.91 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  27.91 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.97 
 
 
389 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  27.71 
 
 
403 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.36 
 
 
373 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.51 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.28 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  26.75 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.6 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.93 
 
 
413 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.9 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.43 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.6 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.38 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  22.99 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.97 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  23.73 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  20.82 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.08 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  23.1 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  20.94 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  22.19 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  26.58 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.47 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  26.5 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.25 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.89 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  21.24 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.94 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.08 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  23.56 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  20.34 
 
 
381 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.21 
 
 
392 aa  63.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.4 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.7 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  21.52 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.28 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.22 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.12 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  24.64 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.32 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  22.53 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25 
 
 
481 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  25.77 
 
 
537 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.74 
 
 
400 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.38 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.89 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  24.89 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  20.66 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.2 
 
 
397 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  26.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  20.57 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  24.23 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.25 
 
 
402 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.75 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.75 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  21.97 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  24.44 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.75 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  18.6 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.33 
 
 
710 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  23.15 
 
 
528 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.75 
 
 
390 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  24.89 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  25.76 
 
 
269 aa  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>