89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2161 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  100 
 
 		 406 aa  813    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  43.01 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  43.01 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  37.6 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  36.6 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  36.81 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  36.57 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  31.74 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  29.92 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  31.23 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  30.46 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  30.46 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  30.46 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  30.46 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  30.46 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  30.46 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  30.46 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  30.47 
 
 		 447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  30.47 
 
 		 447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  29.92 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  31.6 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  30.77 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  29.12 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  31.1 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  30.18 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.45 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  32.39 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.25 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.99 
 
 		 508 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.14 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  27.29 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.55 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25.24 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  26.13 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  26.13 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  21.07 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  22.15 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.27 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  23.81 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.28 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  23.85 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.35 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.59 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.01 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.25 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20.98 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.27 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.28 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.47 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.08 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  21.67 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.35 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.45 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.21 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  25.22 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.48 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.45 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.26 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.65 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.05 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.22 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.65 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.03 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.65 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.65 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  22.64 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.88 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  25.25 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.76 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.69 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>