More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4528 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 710 aa  1417    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  46.38 
 
 		 750 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  33.38 
 
 		 756 aa  355  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.91 
 
 		 734 aa  294  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 738 aa  269  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  28.42 
 
 		 758 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  29.38 
 
 		 758 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.62 
 
 		 788 aa  250  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  28.59 
 
 		 772 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.63 
 
 		 756 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  29.66 
 
 		 753 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 745 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.58 
 
 		 739 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 		 764 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  28.51 
 
 		 776 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 748 aa  225  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 738 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.49 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 737 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.89 
 
 		 778 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 759 aa  213  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 		 751 aa  213  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  26.56 
 
 		 782 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.45 
 
 		 756 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  28.22 
 
 		 789 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.38 
 
 		 756 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.2 
 
 		 779 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 731 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.74 
 
 		 726 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.73 
 
 		 779 aa  191  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 730 aa  190  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 701 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.36 
 
 		 721 aa  188  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  26.4 
 
 		 872 aa  187  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.44 
 
 		 737 aa  186  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  28.02 
 
 		 733 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  27.6 
 
 		 789 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  27.6 
 
 		 771 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 		 711 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.06 
 
 		 727 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 750 aa  170  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.23 
 
 		 770 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.35 
 
 		 753 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.26 
 
 		 772 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 734 aa  164  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.44 
 
 		 745 aa  163  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 704 aa  161  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.75 
 
 		 739 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.33 
 
 		 722 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.11 
 
 		 527 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.35 
 
 		 797 aa  151  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  30.43 
 
 		 718 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  25.7 
 
 		 687 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 731 aa  145  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  27.54 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  23.68 
 
 		 790 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.67 
 
 		 747 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 		 731 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 724 aa  137  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.02 
 
 		 739 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.64 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 726 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.96 
 
 		 729 aa  134  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 749 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  30.05 
 
 		 764 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 595 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 804 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.91 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.89 
 
 		 720 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 		 774 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 718 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.99 
 
 		 748 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.75 
 
 		 806 aa  124  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.93 
 
 		 820 aa  124  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  24.56 
 
 		 736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  23.48 
 
 		 790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  37.15 
 
 		 492 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  24.55 
 
 		 572 aa  120  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  25.11 
 
 		 773 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 537 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.42 
 
 		 720 aa  120  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  24.68 
 
 		 572 aa  120  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.71 
 
 		 794 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.24 
 
 		 742 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.37 
 
 		 508 aa  119  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.12 
 
 		 730 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  26.54 
 
 		 726 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  25.45 
 
 		 802 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  25.89 
 
 		 720 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  28.8 
 
 		 735 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  22.64 
 
 		 814 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  25.69 
 
 		 732 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  21.31 
 
 		 722 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  26.93 
 
 		 740 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 707 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.44 
 
 		 736 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>