97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4852 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  792    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  94.95 
 
 		 396 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  77.97 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  66.67 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  49.1 
 
 		 394 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  49.1 
 
 		 394 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  36.6 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  31.17 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  27.22 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.13 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.13 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  28.93 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.58 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  27.85 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  27.18 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  27.59 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  27.59 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  27.59 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  27.59 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  27.59 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  27.59 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  27.59 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  29.24 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.28 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.11 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  26.18 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  28.8 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 424 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.22 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.49 
 
 		 508 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  25.6 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  24.56 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  24.56 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.72 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  21.29 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  21.94 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.9 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  23.38 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  22.32 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.59 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.66 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.51 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.07 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  26.95 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  19.68 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.44 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.94 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  21.65 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.08 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  23.56 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.03 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.05 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  23.59 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  20 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.6 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  21.16 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.06 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  22.41 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.53 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.3 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  24.91 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.84 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  21.05 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  18.65 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  22.02 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.8 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  21.3 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  24.67 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  25.08 
 
 		 537 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.37 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.67 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  21.38 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  20.66 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  25.4 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  25.4 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  25.4 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  25.4 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  25.4 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  25.4 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.05 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  22.78 
 
 		 524 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>