139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2739 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  100 
 
 		 481 aa  939    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  49.55 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  51.91 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  35.52 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  27.39 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 376 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 373 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  29.02 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.14 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.27 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 373 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  27.97 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.56 
 
 		 389 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.68 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 444 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.64 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.42 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.57 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 416 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.68 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 430 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  26.33 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  25.33 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 416 aa  90.9  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.03 
 
 		 400 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.06 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.34 
 
 		 399 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  28.15 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  28.73 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  25.15 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  25.88 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.46 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.86 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.15 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.87 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.74 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.56 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  25.8 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.52 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  23.63 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.78 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  24.94 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  24.94 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.71 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.02 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  25.88 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.06 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.49 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.06 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.98 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.07 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  25.59 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  25.59 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  25.59 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  25.59 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  25.59 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  25.59 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  25.59 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.65 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.45 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.35 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  23.44 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  26.59 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.57 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.13 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  25.77 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  25.44 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.5 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  21.66 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.51 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  24.59 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  24.93 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  24.05 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  24.05 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  24.05 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  24.16 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  21.46 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.38 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.42 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.42 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.14 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  24.11 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.92 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  24.65 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  23.71 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  23.99 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  23.62 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>