102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0071 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  100 
 
 		 397 aa  794    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  28.69 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.83 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.83 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  30.23 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  28.18 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  28.18 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  29.47 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  27.67 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  29.14 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  29.14 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  29.14 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  29.14 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  29.14 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  29.14 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  29.14 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  26.75 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.93 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  27.79 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  22.87 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  28.19 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.21 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  29.77 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  27.81 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.51 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  27.25 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  29.37 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.99 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  26.25 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  26.32 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.92 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  31.82 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  32.47 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  22.39 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  22.78 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  21.31 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  27.7 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5399  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  32.2 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.73 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  22.3 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.73 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 501 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  23.6 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.92 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.57 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1482  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.68 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.712271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4938  helix-turn-helix, Fis-type  31.36 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.05 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.08 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4048  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650008  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  22.46 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.09 
 
 		 444 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.69 
 
 		 400 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.38 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  19.22 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.09 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03680  C4 dicarboxylate two-component response regulator, sigma54-dependent; DctD2  33.05 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  22.79 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3226  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0642  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  20.76 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2407  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0201  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1392  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0458  C4-dicarboxylate transport transcriptional response regulator DctD  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0478  C4-dicarboxylate transport transcriptional response regulator DctD  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2818  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3127  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  22.11 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  21.51 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  24.79 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  21.54 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.15 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0969  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.627718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.77 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1141  DNA-binding response regulator  28.4 
 
 		 210 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.780315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4294  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.595978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.78 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  24.36 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  22.11 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  22.11 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>