229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2569 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  100 
 
 
524 aa  1024    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  35.86 
 
 
537 aa  300  5e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  28.23 
 
 
419 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  30.84 
 
 
383 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.49 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  27.43 
 
 
406 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
419 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.16 
 
 
381 aa  93.2  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.47 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.14 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25 
 
 
392 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25.32 
 
 
412 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.15 
 
 
398 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  22.22 
 
 
430 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.14 
 
 
381 aa  87.4  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.57 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.82 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  26.69 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.85 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.41 
 
 
416 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.63 
 
 
400 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  27.64 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  27.06 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.82 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.82 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  21.74 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.32 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.1 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  25.46 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  28.63 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.68 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  27.76 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.67 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.26 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  27.38 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  26.55 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.84 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.76 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.54 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  28.12 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  24.81 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.93 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.88 
 
 
401 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  24.44 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.7 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.64 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.84 
 
 
407 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.59 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.39 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.16 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.56 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  26.36 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  22.92 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  25.57 
 
 
402 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  25.57 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  25.57 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.17 
 
 
403 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.62 
 
 
397 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.94 
 
 
389 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  23.08 
 
 
419 aa  63.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.85 
 
 
404 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.11 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  26.92 
 
 
266 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
291 aa  60.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  24.42 
 
 
402 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 
294 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.47 
 
 
508 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.18 
 
 
587 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  26.35 
 
 
580 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  27.21 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  24.31 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.29 
 
 
295 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 
295 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  26.42 
 
 
266 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  25.67 
 
 
397 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  26.18 
 
 
424 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  29.71 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  23.92 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  30.05 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  30.05 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  30.05 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  26.73 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  30.05 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  26.73 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  30.05 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  30.05 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  29.51 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  26.73 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  26.73 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  26.73 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  26.73 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  26.73 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>