More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0093 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  84.09 
 
 
266 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  76.89 
 
 
264 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  76.05 
 
 
265 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  75.29 
 
 
266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  72.35 
 
 
264 aa  400  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  72.35 
 
 
264 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  73 
 
 
263 aa  394  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  71.1 
 
 
264 aa  390  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  74.9 
 
 
260 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  72.14 
 
 
266 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  68.44 
 
 
265 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  69.85 
 
 
265 aa  362  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  67.56 
 
 
266 aa  361  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  67.04 
 
 
267 aa  360  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  67.42 
 
 
267 aa  360  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  67.55 
 
 
265 aa  359  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  358  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  357  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  67.17 
 
 
265 aa  357  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  67.17 
 
 
265 aa  357  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  357  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  357  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  357  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  67.17 
 
 
265 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  67.05 
 
 
270 aa  354  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  66.29 
 
 
270 aa  351  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  63.74 
 
 
265 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  63.74 
 
 
265 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  62.02 
 
 
266 aa  341  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  62.12 
 
 
266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  63.12 
 
 
265 aa  335  5e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1461  septum site-determining protein MinD  62.41 
 
 
266 aa  335  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  60.23 
 
 
263 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  56.76 
 
 
273 aa  318  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  56.27 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  57.36 
 
 
267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  58.56 
 
 
266 aa  300  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  59.16 
 
 
260 aa  300  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  54.85 
 
 
269 aa  299  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1399  septum site-determining protein MinD  61.45 
 
 
264 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000334804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  56.27 
 
 
265 aa  291  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  56.27 
 
 
265 aa  291  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  56.65 
 
 
266 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3383  septum site-determining protein MinD  56.18 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  54.75 
 
 
264 aa  279  3e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1259  septum site-determining protein MinD  56.06 
 
 
266 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130783  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  55.43 
 
 
268 aa  275  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  51.89 
 
 
267 aa  275  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  55.43 
 
 
268 aa  274  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  55.81 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  50.55 
 
 
269 aa  271  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  50.55 
 
 
269 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  50.55 
 
 
269 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  50.18 
 
 
269 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  50.18 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  49.82 
 
 
269 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  49.82 
 
 
269 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  49.81 
 
 
269 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  49.82 
 
 
269 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  49.82 
 
 
269 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  50.55 
 
 
269 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  50.74 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  49.82 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  49.82 
 
 
271 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0679  septum site-determining protein  52.22 
 
 
269 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0597  septum site-determining protein MinD  52.22 
 
 
269 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.992631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  50 
 
 
271 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  50.19 
 
 
271 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  52.38 
 
 
272 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1931  septum site-determining protein MinD  49.26 
 
 
269 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000172441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  49.45 
 
 
269 aa  262  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000684278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  47.97 
 
 
271 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  50.94 
 
 
274 aa  261  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  51.29 
 
 
277 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  49.08 
 
 
270 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1234  septum site-determining protein MinD  48.71 
 
 
271 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246291  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  49.63 
 
 
269 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  49.26 
 
 
271 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  49.82 
 
 
269 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  50.78 
 
 
270 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  49.08 
 
 
269 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  51.17 
 
 
270 aa  260  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01150  membrane ATPase of the MinC-MinD-MinE system  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1275  cell division inhibitor MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000562763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01160  hypothetical protein  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1974  cell division inhibitor MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102785  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  49.26 
 
 
270 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  47.43 
 
 
270 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  52.82 
 
 
271 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  47.43 
 
 
270 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1837  septum site-determining protein MinD  51.59 
 
 
269 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2372  cell division inhibitor MinD  48.9 
 
 
270 aa  258  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000838785  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  48.34 
 
 
270 aa  258  7e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>