More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5493 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  94.28 
 
 
402 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  99.5 
 
 
402 aa  807    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  100 
 
 
402 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  83.33 
 
 
402 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  82.84 
 
 
402 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  100 
 
 
402 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  69.9 
 
 
402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  69.4 
 
 
402 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  69.15 
 
 
402 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  68.91 
 
 
402 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  45.53 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  41.41 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  42.24 
 
 
397 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  40.59 
 
 
397 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  39.6 
 
 
400 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  40.2 
 
 
400 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  38.52 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  37.22 
 
 
400 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
387 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  33.25 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  35.36 
 
 
391 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.78 
 
 
381 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.24 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.47 
 
 
381 aa  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.81 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25.34 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  25.82 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.55 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.39 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.91 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.97 
 
 
377 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  27.59 
 
 
420 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.93 
 
 
416 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  28.47 
 
 
373 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  20.83 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.68 
 
 
376 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  28.04 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.63 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.06 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.71 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.39 
 
 
580 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.21 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  24.18 
 
 
430 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.68 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  25.63 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  26.16 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.4 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  23.01 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  22.94 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  25.64 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  25.25 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.78 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.92 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.55 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  26.54 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.44 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25.67 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.56 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  26.98 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.33 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  26.55 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  24.28 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.12 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.57 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.63 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.49 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.36 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  26.35 
 
 
587 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.66 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.01 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  23.73 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  22.22 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  23.7 
 
 
528 aa  69.7  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  21.79 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  23.47 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23.8 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  23.73 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.92 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.73 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  22.6 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  23.56 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.14 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  22.38 
 
 
447 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  22.38 
 
 
447 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  33.11 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  23.16 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  24.72 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  25 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  22.9 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  27.33 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  28 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  23.28 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  23.27 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  23.22 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  24.92 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  27.05 
 
 
481 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>