249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6001 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 402 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  82.34 
 
 		 402 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 402 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  100 
 
 		 402 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  98.76 
 
 		 402 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 402 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  67.66 
 
 		 402 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  67.91 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  67.66 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  66.92 
 
 		 402 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  43 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 397 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  41.16 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  40.46 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  39.66 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  39.07 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  38.42 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  37.93 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  37.36 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  33.64 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.68 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.5 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25.51 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.64 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.32 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.58 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.14 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.72 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.89 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  25.59 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.74 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.36 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  26.48 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.93 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.99 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.72 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.14 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  25.28 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.3 
 
 		 580 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  26.16 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.81 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.46 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.3 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.38 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.92 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  29.55 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.16 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  26.35 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.59 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.45 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.87 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  28.63 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 587 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  24.01 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  22.93 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  29.06 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.55 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  23.26 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.38 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  23.81 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  23.01 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.24 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  24.01 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  24.01 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  23.13 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  21.52 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  24.76 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  21.53 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  24.24 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  24.04 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.91 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.88 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24.34 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>