More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4620 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  100 
 
 		 416 aa  839    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  80.63 
 
 		 444 aa  686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  56.66 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  55.69 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  34.73 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  31.27 
 
 		 430 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  31.83 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  30.87 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  31.64 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 373 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  32.37 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.95 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  34.75 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  27.49 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.7 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.07 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.69 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  30.56 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.94 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.52 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  31.66 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.42 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 587 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.07 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.78 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.88 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.44 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.05 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  26.14 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  26.63 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  27.45 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  26.09 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  26.93 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  25.65 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.35 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  25.86 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  26.69 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.42 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23.87 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.08 
 
 		 447 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.08 
 
 		 447 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  25.55 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.36 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  27.55 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.14 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  25.29 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  25.55 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  26.13 
 
 		 580 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.46 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  27.55 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  26.75 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.63 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.76 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  27.93 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.09 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  25.92 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.32 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.12 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  23.95 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  23.85 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  28.29 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  28.29 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  25.95 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  26.64 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.7 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  23.34 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.23 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.65 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.23 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  27.52 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03531  putative septum site-determining protein MinD  26.62 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>