151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2691 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  100 
 
 		 389 aa  787    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  67.69 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  34.17 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  34.05 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  32.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  32.51 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  34.21 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  34.21 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  34.21 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  34.21 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  34.21 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  34.21 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  34.24 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  32.01 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  31.02 
 
 		 528 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.79 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  29.08 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  30.75 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  30.4 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  31.35 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  30.41 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  30.7 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  30.84 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  30.75 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  30.28 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 428 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  29.97 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  29.97 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 437 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.57 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.7 
 
 		 580 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.46 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.55 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.98 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.08 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  22.92 
 
 		 405 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.22 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  27.8 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.74 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  29.86 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  28.89 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.47 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.32 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.27 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.46 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.12 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.54 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  32.03 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  27.35 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  27.35 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  30.13 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.51 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.48 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  27.54 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.14 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  26.85 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  29.34 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.97 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.62 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  28.75 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  28.75 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  28.75 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  23.16 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  28.09 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.35 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>