107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4398 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  100 
 
 		 380 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.83 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.91 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  27.44 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.58 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.58 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.5 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.79 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.46 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.26 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.24 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  23.38 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  25.21 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.41 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  25 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  24.72 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  24.72 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  25 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.88 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.46 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  24.09 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 587 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.42 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.03 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  26.46 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.48 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  24.37 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.84 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  24.37 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  24.37 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  24.37 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  24.37 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  24.37 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.01 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  19.95 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  24.45 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  26.01 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  22.3 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  22.22 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  20.11 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  27.39 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  24.64 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.06 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  25.23 
 
 		 422 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.13 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  25.68 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  25.23 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  23.7 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  23.21 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  23.7 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  20.21 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  21.77 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  24.39 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  24.39 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.7 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  23.93 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.1 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.39 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  21.43 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  24.37 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  25.23 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  20.08 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  20.59 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  21.83 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.2 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  22.96 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  22.53 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.01 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  20.42 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20.33 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.32 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>