More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2027 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  73.88 
 
 
301 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  70.85 
 
 
297 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  71.05 
 
 
297 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.74 
 
 
300 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  64.64 
 
 
293 aa  381  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  64.48 
 
 
290 aa  374  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  66.67 
 
 
284 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  68.58 
 
 
288 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  58.27 
 
 
269 aa  329  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  58.85 
 
 
295 aa  298  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.15 
 
 
295 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.63 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  55.23 
 
 
416 aa  278  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  54.03 
 
 
278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
317 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  49.6 
 
 
401 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.62 
 
 
308 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  49.43 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  47.83 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.39 
 
 
471 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
287 aa  259  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.81 
 
 
303 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  49.21 
 
 
278 aa  257  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  47.41 
 
 
272 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.19 
 
 
289 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.19 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  50 
 
 
280 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.79 
 
 
289 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  49.05 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  46.09 
 
 
302 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  47.48 
 
 
296 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.66 
 
 
289 aa  249  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.4 
 
 
293 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  46.69 
 
 
298 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  47.77 
 
 
265 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  48.21 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  53.16 
 
 
358 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  48.21 
 
 
286 aa  244  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  53.16 
 
 
358 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.41 
 
 
270 aa  244  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  45.1 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  46.56 
 
 
415 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  43.97 
 
 
298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  52.79 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  55.7 
 
 
360 aa  242  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  47.33 
 
 
291 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  47.86 
 
 
296 aa  239  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  46.76 
 
 
375 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.14 
 
 
298 aa  237  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  52.36 
 
 
363 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  45.23 
 
 
304 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  51.44 
 
 
359 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  50.61 
 
 
373 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  51.05 
 
 
378 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  48.23 
 
 
353 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  54.74 
 
 
363 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  51.61 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.07 
 
 
348 aa  235  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  48.23 
 
 
353 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  51.97 
 
 
374 aa  235  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.43 
 
 
266 aa  235  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  51.07 
 
 
363 aa  234  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  51.42 
 
 
281 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  51.41 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  44.84 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  47.68 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  50.81 
 
 
358 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  47.51 
 
 
370 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  50.43 
 
 
372 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  48.61 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  52.36 
 
 
363 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  52.16 
 
 
362 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  50 
 
 
374 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  52.26 
 
 
361 aa  231  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  47.74 
 
 
379 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  49.05 
 
 
384 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  51.46 
 
 
357 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  52.59 
 
 
365 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  48.85 
 
 
356 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  50 
 
 
363 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  47.71 
 
 
353 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  46.04 
 
 
330 aa  229  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  48.74 
 
 
374 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.31 
 
 
415 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  46.99 
 
 
361 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  52.68 
 
 
376 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  47.43 
 
 
354 aa  228  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  48.39 
 
 
345 aa  228  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  46.15 
 
 
347 aa  228  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  51.1 
 
 
372 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  51.93 
 
 
362 aa  228  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  51.5 
 
 
362 aa  228  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  47.56 
 
 
370 aa  228  8e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  50.85 
 
 
364 aa  228  9e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  53.07 
 
 
365 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  48.93 
 
 
387 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  49.62 
 
 
363 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  48.66 
 
 
362 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  46.56 
 
 
357 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>