More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3164 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
317 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.01 
 
 
293 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  63.23 
 
 
401 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  64.41 
 
 
415 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  60.61 
 
 
416 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  62.4 
 
 
471 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53 
 
 
295 aa  294  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.56 
 
 
288 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.61 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  55.47 
 
 
295 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.15 
 
 
303 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  48.58 
 
 
285 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  49.8 
 
 
285 aa  269  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  48.57 
 
 
292 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  49.08 
 
 
284 aa  261  8e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  43.51 
 
 
301 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  51.41 
 
 
293 aa  258  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  43.83 
 
 
297 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  50 
 
 
297 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  44.91 
 
 
296 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  45.17 
 
 
272 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  46.92 
 
 
286 aa  248  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  47.04 
 
 
302 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  47.35 
 
 
269 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  46.56 
 
 
291 aa  245  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  46.89 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  45.49 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  46.1 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.61 
 
 
300 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  46.01 
 
 
278 aa  242  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.42 
 
 
289 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.17 
 
 
289 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.04 
 
 
289 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  43.73 
 
 
265 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  43.28 
 
 
302 aa  237  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  42.12 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  44.88 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.35 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  42.65 
 
 
290 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.03 
 
 
289 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  42.35 
 
 
341 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  47.62 
 
 
297 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  46.77 
 
 
298 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  48.55 
 
 
280 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  43.82 
 
 
278 aa  226  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.75 
 
 
270 aa  223  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  47.5 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  47.5 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  41.61 
 
 
330 aa  219  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  41.69 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.22 
 
 
348 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.22 
 
 
373 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  46.69 
 
 
368 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.12 
 
 
363 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  44.92 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  46.72 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  46.8 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.08 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.45 
 
 
370 aa  212  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.45 
 
 
291 aa  212  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  44.22 
 
 
378 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  44.22 
 
 
375 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.35 
 
 
374 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.04 
 
 
372 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  36.57 
 
 
368 aa  209  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  47.22 
 
 
345 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  45.02 
 
 
382 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  44.9 
 
 
363 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  46.8 
 
 
370 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  44.98 
 
 
357 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.48 
 
 
376 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  43.35 
 
 
296 aa  208  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  46.12 
 
 
365 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  47.04 
 
 
372 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  48.12 
 
 
379 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  45.24 
 
 
347 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
266 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  42.86 
 
 
394 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  44.72 
 
 
394 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  44.72 
 
 
387 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  45.34 
 
 
285 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  45.49 
 
 
374 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  42.16 
 
 
384 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  44.62 
 
 
358 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  45.06 
 
 
361 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  49.33 
 
 
354 aa  205  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.31 
 
 
395 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  44.53 
 
 
362 aa  205  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  41.04 
 
 
368 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  45.63 
 
 
374 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  45.9 
 
 
364 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.44 
 
 
362 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  45.87 
 
 
354 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  45.34 
 
 
362 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  42.86 
 
 
331 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.72 
 
 
363 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  45.86 
 
 
353 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  45.49 
 
 
363 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  44.36 
 
 
356 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  37.63 
 
 
296 aa  203  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>