More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1303 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  58.78 
 
 
292 aa  330  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  57.71 
 
 
286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  53.91 
 
 
302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  51.84 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  51.94 
 
 
304 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  47.96 
 
 
295 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.07 
 
 
295 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  50.76 
 
 
298 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  46.45 
 
 
298 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  48.51 
 
 
297 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  50.39 
 
 
285 aa  271  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.6 
 
 
288 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
303 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.83 
 
 
308 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  47.79 
 
 
280 aa  259  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.67 
 
 
471 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  46.52 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  46.21 
 
 
301 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  45.7 
 
 
401 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.69 
 
 
270 aa  249  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  48.36 
 
 
284 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  46.13 
 
 
415 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  46.99 
 
 
278 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.56 
 
 
317 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  44.61 
 
 
416 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  45.45 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  52.08 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.19 
 
 
272 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.48 
 
 
300 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  47.33 
 
 
285 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  42.76 
 
 
288 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  46.04 
 
 
341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  44.79 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  46.29 
 
 
290 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  46.3 
 
 
297 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.68 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  45.2 
 
 
330 aa  231  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  44.27 
 
 
302 aa  228  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  42.48 
 
 
269 aa  226  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  44.4 
 
 
373 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  43.6 
 
 
375 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  46.51 
 
 
336 aa  221  8e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.31 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  43.2 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  41.43 
 
 
265 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.57 
 
 
287 aa  219  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.94 
 
 
291 aa  218  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  43.6 
 
 
361 aa  218  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  48.47 
 
 
347 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3248  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.67 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.73 
 
 
289 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.67 
 
 
266 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  44.21 
 
 
379 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  44.73 
 
 
374 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.49 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  43.33 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.81 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  45.42 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  41.73 
 
 
370 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.07 
 
 
374 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  41.86 
 
 
394 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.56 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  39.15 
 
 
359 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.62 
 
 
298 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.68 
 
 
247 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  40.75 
 
 
372 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  46.78 
 
 
357 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.77 
 
 
269 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.27 
 
 
363 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  42 
 
 
372 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  42.8 
 
 
364 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  44.66 
 
 
296 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  39.27 
 
 
281 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.97 
 
 
345 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  45.56 
 
 
368 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  41.09 
 
 
302 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.4 
 
 
348 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  45.69 
 
 
387 aa  205  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.56 
 
 
395 aa  205  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  41.46 
 
 
370 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  42.74 
 
 
379 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.09 
 
 
358 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.09 
 
 
358 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  43.31 
 
 
361 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  45.26 
 
 
389 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  45.26 
 
 
394 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.57 
 
 
363 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  39.47 
 
 
349 aa  203  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  42.13 
 
 
353 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  41.46 
 
 
376 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  42.13 
 
 
353 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  40.08 
 
 
357 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  45.06 
 
 
351 aa  202  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  42.91 
 
 
415 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  44.26 
 
 
281 aa  202  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  44.98 
 
 
358 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  44.07 
 
 
358 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>