More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1128 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  68.46 
 
 
296 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  65.66 
 
 
298 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  70.22 
 
 
297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  66.55 
 
 
304 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  63.76 
 
 
298 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  50.69 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  48.94 
 
 
292 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  54.59 
 
 
286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.74 
 
 
288 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  48.29 
 
 
295 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.69 
 
 
295 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  48.13 
 
 
285 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  45 
 
 
401 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  47.37 
 
 
416 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.92 
 
 
303 aa  254  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  47.43 
 
 
471 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  44.76 
 
 
301 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  46.09 
 
 
285 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.13 
 
 
289 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.59 
 
 
289 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  49.12 
 
 
297 aa  250  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 
317 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.54 
 
 
289 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.88 
 
 
300 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  43 
 
 
302 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  40.96 
 
 
293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  43.84 
 
 
284 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.46 
 
 
272 aa  245  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  47.6 
 
 
415 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  44.57 
 
 
297 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  42.55 
 
 
290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.99 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  46.09 
 
 
288 aa  242  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.61 
 
 
289 aa  242  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  48.12 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.26 
 
 
270 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  44.07 
 
 
278 aa  232  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  43.64 
 
 
269 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.52 
 
 
293 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  45.41 
 
 
280 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  42.29 
 
 
265 aa  222  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  41.94 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  45.59 
 
 
280 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3248  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.6 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.21 
 
 
367 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  41.29 
 
 
281 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.77 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.06 
 
 
353 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  41.34 
 
 
347 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.86 
 
 
266 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.37 
 
 
353 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  41.83 
 
 
354 aa  209  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  44.27 
 
 
330 aa  209  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  42.8 
 
 
345 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  43.28 
 
 
378 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  43.28 
 
 
375 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  44.76 
 
 
281 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.8 
 
 
361 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  39.16 
 
 
302 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.72 
 
 
247 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  44.44 
 
 
296 aa  206  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
353 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  38.46 
 
 
349 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.64 
 
 
348 aa  205  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.17 
 
 
358 aa  205  9e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  40.8 
 
 
373 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  40.15 
 
 
361 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  37.86 
 
 
336 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  39.76 
 
 
370 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.26 
 
 
247 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  43.09 
 
 
296 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.57 
 
 
358 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  43.91 
 
 
285 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.29 
 
 
358 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  41.95 
 
 
382 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.29 
 
 
358 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  37.76 
 
 
336 aa  202  6e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  40.56 
 
 
357 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  41.82 
 
 
291 aa  202  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
360 aa  202  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  40.39 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  42.57 
 
 
363 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  37.81 
 
 
371 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  44.74 
 
 
360 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  41.34 
 
 
394 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  40.16 
 
 
374 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  41.06 
 
 
372 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  41.15 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.31 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  38.95 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.59 
 
 
357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  40.64 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.22 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  44.1 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  42.98 
 
 
379 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  39.92 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  39.38 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  38.81 
 
 
351 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>