More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0621 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  71.97 
 
 
297 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  71.13 
 
 
297 aa  428  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  73.88 
 
 
285 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.53 
 
 
300 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  64.71 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  67.61 
 
 
293 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  63.51 
 
 
290 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  66.67 
 
 
284 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  59.07 
 
 
269 aa  325  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  54.26 
 
 
295 aa  281  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.12 
 
 
295 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
288 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  51.19 
 
 
278 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  48.86 
 
 
278 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
287 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  46.07 
 
 
296 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.51 
 
 
317 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  47.54 
 
 
285 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  47.92 
 
 
272 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
289 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  51.39 
 
 
416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.2 
 
 
289 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  45.58 
 
 
302 aa  258  7e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.49 
 
 
289 aa  258  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.8 
 
 
289 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  48.65 
 
 
265 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.44 
 
 
303 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  51.89 
 
 
353 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  51.89 
 
 
353 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  47.62 
 
 
302 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  46.21 
 
 
291 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.59 
 
 
308 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  51.6 
 
 
358 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.6 
 
 
270 aa  249  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  51.6 
 
 
358 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  48.81 
 
 
292 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  50.2 
 
 
363 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  45.94 
 
 
401 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
356 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  47.83 
 
 
304 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  46.48 
 
 
286 aa  245  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  51.68 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  50.67 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  43.01 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  48.68 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.82 
 
 
298 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  47.83 
 
 
297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  48.37 
 
 
373 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  49.06 
 
 
362 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  45.02 
 
 
375 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  49.8 
 
 
363 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  51.69 
 
 
363 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.17 
 
 
372 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  47.45 
 
 
370 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  51.19 
 
 
285 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  48.62 
 
 
298 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  48.3 
 
 
361 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.8 
 
 
266 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  44.12 
 
 
415 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.56 
 
 
378 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  47.17 
 
 
372 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  49.8 
 
 
363 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  50.4 
 
 
363 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  48.1 
 
 
361 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.52 
 
 
293 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  49.4 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  52.42 
 
 
358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  51.17 
 
 
358 aa  235  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  49.8 
 
 
415 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  47.88 
 
 
359 aa  235  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  48.31 
 
 
362 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  46.18 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.24 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  49.59 
 
 
374 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  41.61 
 
 
357 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.81 
 
 
471 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.6 
 
 
362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  50 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  42.9 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  49.36 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  49.16 
 
 
374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  49.36 
 
 
394 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  48.4 
 
 
361 aa  232  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.95 
 
 
348 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.21 
 
 
362 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  42.86 
 
 
379 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.74 
 
 
362 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  48.61 
 
 
357 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  46.82 
 
 
362 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  49.56 
 
 
364 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  43.14 
 
 
384 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  51.74 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  48.41 
 
 
286 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  48.41 
 
 
354 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  46.8 
 
 
389 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  50.2 
 
 
363 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.98 
 
 
362 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  53.51 
 
 
365 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  43.42 
 
 
330 aa  230  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>