More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1306 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  805    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  57.53 
 
 
415 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  53.35 
 
 
416 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.69 
 
 
317 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.39 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.54 
 
 
293 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  56.13 
 
 
295 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.59 
 
 
308 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.7 
 
 
295 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.63 
 
 
303 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.08 
 
 
288 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  49.6 
 
 
285 aa  269  8e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  49.22 
 
 
285 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  52 
 
 
269 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  47.83 
 
 
292 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  49.4 
 
 
297 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  50 
 
 
284 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  49.26 
 
 
298 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  45 
 
 
302 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  47.39 
 
 
296 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  49.4 
 
 
297 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  48.72 
 
 
298 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  45.7 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.89 
 
 
272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  47.27 
 
 
286 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  47.83 
 
 
297 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.51 
 
 
300 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  46.59 
 
 
302 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  46.83 
 
 
293 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  45.94 
 
 
301 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  49.81 
 
 
304 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  49.81 
 
 
341 aa  249  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  46.07 
 
 
278 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  47.98 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  48.65 
 
 
278 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  45.56 
 
 
290 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  43.01 
 
 
336 aa  239  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  45.67 
 
 
288 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  44.9 
 
 
265 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.61 
 
 
270 aa  236  7e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  50.82 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.27 
 
 
289 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.51 
 
 
289 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  45.04 
 
 
330 aa  229  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
287 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.75 
 
 
289 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.79 
 
 
289 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  43.92 
 
 
349 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  43.33 
 
 
296 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  41.97 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.42 
 
 
269 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.12 
 
 
348 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  47.83 
 
 
368 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  46.18 
 
 
374 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  46.96 
 
 
360 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  48.25 
 
 
356 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  46.91 
 
 
281 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.27 
 
 
305 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  40.89 
 
 
291 aa  216  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.25 
 
 
298 aa  216  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.42 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.42 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  44.98 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.99 
 
 
247 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.4 
 
 
353 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.4 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  47.66 
 
 
285 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  44.75 
 
 
373 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 
357 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  44.57 
 
 
331 aa  210  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.63 
 
 
395 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  46.48 
 
 
345 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  44.02 
 
 
353 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  48.67 
 
 
351 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  45.83 
 
 
382 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.18 
 
 
247 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  44.22 
 
 
363 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  43.73 
 
 
382 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  44.36 
 
 
354 aa  206  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.16 
 
 
358 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  44.66 
 
 
378 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  47.62 
 
 
379 aa  205  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  44.66 
 
 
375 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  43.94 
 
 
354 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  44.84 
 
 
358 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  39.31 
 
 
368 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  39.84 
 
 
370 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  43.8 
 
 
306 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.43 
 
 
363 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  41.11 
 
 
296 aa  203  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  40.67 
 
 
307 aa  203  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  45.88 
 
 
379 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.59 
 
 
266 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.98 
 
 
363 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  43.78 
 
 
357 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  44.53 
 
 
361 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  46.31 
 
 
361 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  44.02 
 
 
376 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  46.31 
 
 
361 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  46.31 
 
 
361 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>