More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0304 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
266 aa  539  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.04 
 
 
270 aa  368  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.26 
 
 
247 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.09 
 
 
247 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  50.6 
 
 
278 aa  248  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  49.04 
 
 
302 aa  245  6e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  48.9 
 
 
288 aa  243  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  52.59 
 
 
290 aa  242  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  49.8 
 
 
301 aa  240  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  49.8 
 
 
297 aa  238  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.19 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  48.43 
 
 
285 aa  235  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.06 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  46.25 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.08 
 
 
367 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.15 
 
 
295 aa  231  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  47.83 
 
 
284 aa  228  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.17 
 
 
358 aa  225  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  46.03 
 
 
286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  47.53 
 
 
278 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  47.22 
 
 
297 aa  224  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  43.98 
 
 
295 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  44.61 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  44.7 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  45.59 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.65 
 
 
287 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  43.98 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.8 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.16 
 
 
348 aa  219  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  45.06 
 
 
358 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.42 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  45.24 
 
 
358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.63 
 
 
272 aa  216  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.48 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  41.06 
 
 
296 aa  215  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.15 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  48.94 
 
 
416 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  44.31 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  45.2 
 
 
363 aa  211  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  43.45 
 
 
280 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  42.47 
 
 
285 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  44.36 
 
 
269 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  40.86 
 
 
302 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  45.59 
 
 
296 aa  209  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  44.4 
 
 
280 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  44.36 
 
 
358 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.36 
 
 
351 aa  207  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
317 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  41.29 
 
 
304 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 
289 aa  206  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  42.68 
 
 
347 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  42.75 
 
 
364 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  43.5 
 
 
336 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 
345 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  42.91 
 
 
287 aa  205  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  42.08 
 
 
361 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  43.92 
 
 
360 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  42.23 
 
 
359 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  42.08 
 
 
367 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  43.59 
 
 
401 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  44.05 
 
 
358 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.94 
 
 
305 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.12 
 
 
303 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  44.62 
 
 
360 aa  201  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.79 
 
 
371 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  43.53 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44.27 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.27 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  46.25 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.76 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.38 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.76 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.23 
 
 
395 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  40 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  46.56 
 
 
370 aa  200  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  44.06 
 
 
291 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  42.35 
 
 
361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.75 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  44.36 
 
 
367 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  41.76 
 
 
286 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  43.11 
 
 
415 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  43.82 
 
 
355 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.43 
 
 
298 aa  198  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  43.35 
 
 
357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.04 
 
 
371 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.92 
 
 
376 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.49 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  41.97 
 
 
369 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  42.31 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  43.65 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  41.41 
 
 
367 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.11 
 
 
371 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  40.87 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  44.78 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  42.91 
 
 
356 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  42.65 
 
 
370 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  42.65 
 
 
370 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  42.65 
 
 
370 aa  195  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>