More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0745 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  57.63 
 
 
295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.02 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.5 
 
 
303 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.83 
 
 
295 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.9 
 
 
288 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  54.94 
 
 
416 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  51.56 
 
 
272 aa  278  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
317 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  50.36 
 
 
290 aa  275  6e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  52.16 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  50.39 
 
 
291 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  50.2 
 
 
296 aa  269  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  49.82 
 
 
288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  48.06 
 
 
297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  48.84 
 
 
415 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.08 
 
 
300 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  54.74 
 
 
471 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  50.61 
 
 
292 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  45.83 
 
 
298 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  49.61 
 
 
297 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  52.94 
 
 
401 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  47.02 
 
 
293 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  47.53 
 
 
304 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  51.06 
 
 
302 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  49.43 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  49.61 
 
 
298 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  47.54 
 
 
301 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.39 
 
 
293 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  50 
 
 
297 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.91 
 
 
289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.91 
 
 
289 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  46.72 
 
 
284 aa  249  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
289 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  44.57 
 
 
278 aa  249  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 
289 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  47.15 
 
 
265 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.8 
 
 
287 aa  246  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  48.85 
 
 
269 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 
270 aa  244  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  44.11 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  46.01 
 
 
278 aa  242  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  45.08 
 
 
336 aa  241  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  46.67 
 
 
341 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  47.45 
 
 
374 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  47.01 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  46.48 
 
 
374 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  45.55 
 
 
281 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  47.88 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  46.64 
 
 
378 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  44.23 
 
 
291 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  49.01 
 
 
371 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  46.3 
 
 
375 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.36 
 
 
269 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  46.12 
 
 
296 aa  229  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.25 
 
 
373 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  41.88 
 
 
302 aa  229  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  46.56 
 
 
358 aa  225  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  45.45 
 
 
382 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  44.69 
 
 
394 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.1 
 
 
358 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.81 
 
 
376 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.12 
 
 
348 aa  223  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  43.98 
 
 
330 aa  223  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 
367 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  46.99 
 
 
358 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  46.99 
 
 
358 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  43.35 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  45.88 
 
 
361 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  45.71 
 
 
379 aa  221  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  47.04 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  43.12 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  46.15 
 
 
370 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  46.59 
 
 
384 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  42.8 
 
 
354 aa  219  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.96 
 
 
358 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.64 
 
 
351 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  47.41 
 
 
371 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 
357 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  43.24 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  43.7 
 
 
372 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0594  chromosome partitioning ATPase protein-like  51.1 
 
 
285 aa  215  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  46.52 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  46.26 
 
 
368 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  39.73 
 
 
368 aa  214  9e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.79 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  43.6 
 
 
370 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  40.88 
 
 
367 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  42.26 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.34 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.53 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  44.53 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  45.88 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  44.08 
 
 
331 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  43.7 
 
 
373 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  42.01 
 
 
347 aa  212  4.9999999999999996e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  45.67 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  42.97 
 
 
363 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  41.52 
 
 
379 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.47 
 
 
266 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>