More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2075 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  77.18 
 
 		 298 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  78.4 
 
 		 297 aa  454  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  75.46 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  66.91 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  63.01 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  50.76 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  52.65 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  49.44 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  45.83 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  50.2 
 
 		 286 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.56 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  48.54 
 
 		 401 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.37 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  48.02 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  46.64 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.67 
 
 		 300 aa  248  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  51.3 
 
 		 290 aa  247  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  46.69 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  43.94 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  46.64 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  47.22 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  48.62 
 
 		 301 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.25 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.52 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  48.47 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.87 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.25 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.85 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  48.21 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.1 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  47.76 
 
 		 471 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  50.22 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  42.91 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.36 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.77 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  45.19 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  46.85 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.94 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  43.85 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  48.22 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  45.24 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.61 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  45.15 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  44.84 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  43.31 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  44.14 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.1 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  44.22 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  44.22 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  43.53 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  46.52 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.76 
 
 		 247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  45.59 
 
 		 330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.34 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  40.32 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  41.91 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  43.24 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.75 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.03 
 
 		 367 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  40 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  43.15 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  42.47 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  42.63 
 
 		 374 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  39.11 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  43.32 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.71 
 
 		 247 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  40.15 
 
 		 281 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.61 
 
 		 291 aa  205  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  42.34 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  42.34 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3248  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.53 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  42.21 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  46.48 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  38.27 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  45.96 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  42.29 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  40.64 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  42.45 
 
 		 379 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  42.62 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2138  hypothetical protein  39.64 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  40.23 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  44.17 
 
 		 394 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  42.11 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  41.8 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  44.17 
 
 		 387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  37.63 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  43.42 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.7 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  42.11 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  40.7 
 
 		 363 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  41.87 
 
 		 361 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  44.63 
 
 		 384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1702  chromosome partitioning ATPase  41.7 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  41.11 
 
 		 359 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  39.18 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  40.48 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>