More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1122 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
471 aa  947    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  55.88 
 
 
416 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  51.84 
 
 
415 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  49.39 
 
 
401 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.4 
 
 
317 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.29 
 
 
293 aa  289  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  56.92 
 
 
295 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.17 
 
 
295 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.58 
 
 
288 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.18 
 
 
303 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.12 
 
 
308 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  50.71 
 
 
292 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  54.74 
 
 
285 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  48.39 
 
 
285 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  46.67 
 
 
291 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  47.12 
 
 
296 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  47.27 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  46.43 
 
 
286 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  48.33 
 
 
304 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  46.46 
 
 
272 aa  239  8e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  48.91 
 
 
278 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  46.56 
 
 
293 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  53.18 
 
 
297 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.22 
 
 
289 aa  236  8e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  52.73 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  46.58 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.22 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.33 
 
 
289 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  48.81 
 
 
301 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  54.3 
 
 
284 aa  234  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.66 
 
 
287 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.29 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  47.76 
 
 
298 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  45.78 
 
 
269 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.22 
 
 
289 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  44.71 
 
 
265 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  46.33 
 
 
336 aa  227  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  50.65 
 
 
298 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.69 
 
 
270 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  45.87 
 
 
288 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  47.27 
 
 
330 aa  220  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  48.02 
 
 
341 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  48.33 
 
 
297 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  46.22 
 
 
331 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  49.78 
 
 
280 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  43.94 
 
 
290 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  41.59 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  42.57 
 
 
302 aa  213  5.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  50.23 
 
 
360 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  41.02 
 
 
368 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  47.33 
 
 
376 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.22 
 
 
269 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  47.6 
 
 
358 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  47.6 
 
 
358 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  46.43 
 
 
348 aa  207  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  46.91 
 
 
370 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  41.88 
 
 
281 aa  206  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  45.83 
 
 
360 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  49.12 
 
 
360 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  49.36 
 
 
368 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  47.7 
 
 
372 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  49.12 
 
 
367 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  39.47 
 
 
370 aa  203  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  46.5 
 
 
394 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.11 
 
 
353 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.69 
 
 
305 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  46.43 
 
 
347 aa  202  8e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  45.64 
 
 
302 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  45.34 
 
 
304 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.28 
 
 
372 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.68 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  46.38 
 
 
379 aa  200  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  47.76 
 
 
373 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  44.64 
 
 
357 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  43.03 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.66 
 
 
353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44.66 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  43.63 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  46.75 
 
 
382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.22 
 
 
298 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  46.91 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.86 
 
 
373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  41.01 
 
 
278 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  44.66 
 
 
354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11060  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor cfd1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C8Q1]  43.18 
 
 
334 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.725803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.97 
 
 
247 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  43.97 
 
 
379 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  46.81 
 
 
415 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  40.96 
 
 
357 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  38.87 
 
 
296 aa  197  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.96 
 
 
348 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0594  chromosome partitioning ATPase protein-like  44.4 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  46.5 
 
 
394 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.11 
 
 
361 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.54 
 
 
363 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  46.5 
 
 
387 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.17 
 
 
419 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.79 
 
 
395 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  48.23 
 
 
364 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  39.92 
 
 
291 aa  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>