More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0628 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
419 aa  848    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.41 
 
 
439 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  55.56 
 
 
282 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  61.38 
 
 
262 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  57.25 
 
 
276 aa  323  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  52.48 
 
 
279 aa  302  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  49.82 
 
 
302 aa  292  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  52.81 
 
 
281 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  50.37 
 
 
277 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  45.45 
 
 
304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  49.83 
 
 
281 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  51.69 
 
 
328 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  51.24 
 
 
328 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  48.04 
 
 
279 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  52.47 
 
 
280 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  50.6 
 
 
269 aa  255  9e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  51.27 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  52.48 
 
 
284 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  46.01 
 
 
284 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  46.01 
 
 
284 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.62 
 
 
298 aa  239  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  54.91 
 
 
282 aa  239  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  48.3 
 
 
277 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  46.01 
 
 
276 aa  234  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  33.58 
 
 
415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  46.75 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.79 
 
 
287 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  34.46 
 
 
416 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  40.96 
 
 
272 aa  216  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  46.64 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  44.64 
 
 
302 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  46.49 
 
 
278 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.51 
 
 
289 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.09 
 
 
348 aa  210  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  46.93 
 
 
280 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  45.15 
 
 
280 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  41.31 
 
 
363 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.3 
 
 
289 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.42 
 
 
471 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.69 
 
 
289 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.3 
 
 
289 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 
351 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.42 
 
 
291 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.07 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  41.53 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.31 
 
 
395 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  41.56 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  38.52 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  41.02 
 
 
292 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  41.03 
 
 
360 aa  199  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.41 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.41 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  41.02 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  41.7 
 
 
358 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  41.35 
 
 
370 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  41.2 
 
 
372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  41.7 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  40.6 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0044  hypothetical protein  40.98 
 
 
308 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  41.74 
 
 
394 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  43.04 
 
 
394 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  42.86 
 
 
281 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  45.58 
 
 
357 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  42.61 
 
 
389 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.98 
 
 
305 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  39.84 
 
 
357 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  42.61 
 
 
387 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  42.34 
 
 
364 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  41.49 
 
 
307 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  44.17 
 
 
364 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  40.43 
 
 
376 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.56 
 
 
371 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  40.43 
 
 
373 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  37.87 
 
 
374 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  44.59 
 
 
360 aa  192  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.98 
 
 
371 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  38.82 
 
 
375 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.98 
 
 
371 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  42.52 
 
 
379 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.98 
 
 
371 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  40.98 
 
 
371 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  41.7 
 
 
371 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.1 
 
 
270 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0041  hypothetical protein  41.08 
 
 
304 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0118047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  39.82 
 
 
382 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  39.21 
 
 
378 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  31.38 
 
 
401 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  38.22 
 
 
287 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  46.35 
 
 
296 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  40.57 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  41.7 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  36.96 
 
 
367 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.38 
 
 
288 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  38.62 
 
 
361 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  39.65 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  41.77 
 
 
295 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
354 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  42.04 
 
 
359 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2138  hypothetical protein  39.75 
 
 
306 aa  189  8e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>