More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1191 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  100 
 
 
304 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  75.42 
 
 
298 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  74.13 
 
 
297 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  72.11 
 
 
298 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  66.55 
 
 
302 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  61.87 
 
 
296 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  50 
 
 
291 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  50.37 
 
 
292 aa  277  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  53.49 
 
 
286 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  45.76 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  47.35 
 
 
295 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
300 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.26 
 
 
288 aa  258  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  45.55 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  44.33 
 
 
297 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  45.16 
 
 
293 aa  249  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  48.41 
 
 
416 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.77 
 
 
270 aa  248  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.04 
 
 
287 aa  247  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  46.67 
 
 
284 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  45.8 
 
 
297 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.37 
 
 
289 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.33 
 
 
471 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.37 
 
 
289 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.61 
 
 
272 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  49.81 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.62 
 
 
289 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.69 
 
 
317 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
308 aa  245  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  48.47 
 
 
290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  44.88 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.01 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.42 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  46.46 
 
 
288 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  45.23 
 
 
285 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.8 
 
 
293 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  42.97 
 
 
265 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  43.69 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  42.14 
 
 
336 aa  229  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  40.62 
 
 
281 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  46.12 
 
 
269 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  44.61 
 
 
278 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  42.15 
 
 
278 aa  225  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  43.92 
 
 
347 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  46.91 
 
 
296 aa  223  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.75 
 
 
269 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  43.51 
 
 
302 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  45.15 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.7 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  41.5 
 
 
330 aa  219  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.96 
 
 
361 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  42.54 
 
 
286 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  40 
 
 
349 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  42.59 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.45 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44 
 
 
353 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44 
 
 
353 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  42.05 
 
 
356 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  44.1 
 
 
280 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 
353 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  41.67 
 
 
277 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.34 
 
 
247 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  45.45 
 
 
281 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.91 
 
 
358 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.91 
 
 
358 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  42.74 
 
 
374 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  42.34 
 
 
415 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.29 
 
 
266 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  40.77 
 
 
304 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  44 
 
 
336 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3248  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.42 
 
 
282 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.94 
 
 
408 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  42.17 
 
 
371 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  45.38 
 
 
361 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  40.91 
 
 
358 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.9 
 
 
247 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  41.63 
 
 
374 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  38.75 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  40.22 
 
 
408 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  42.8 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  41.13 
 
 
345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  46.19 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  43.32 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  41.11 
 
 
364 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  44.54 
 
 
361 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  44.54 
 
 
361 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  44.54 
 
 
361 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  40.98 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  38.87 
 
 
368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  42.8 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  41.6 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  40 
 
 
379 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.68 
 
 
395 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.77 
 
 
305 aa  198  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  42.91 
 
 
369 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  41.7 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  44.4 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  38.55 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  39.09 
 
 
357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>