More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0410 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  86.71 
 
 
297 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  77.18 
 
 
298 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  75.43 
 
 
304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  67.74 
 
 
302 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  64.85 
 
 
296 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  46.45 
 
 
291 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  48.12 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  49.61 
 
 
285 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  48.44 
 
 
286 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  46.59 
 
 
295 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  49.26 
 
 
401 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.36 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.39 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  46.67 
 
 
297 aa  252  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.18 
 
 
289 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  46.27 
 
 
284 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.24 
 
 
295 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.8 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.56 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  43.01 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  43.97 
 
 
285 aa  242  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.97 
 
 
289 aa  242  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  45.32 
 
 
297 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  45.45 
 
 
416 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
308 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.57 
 
 
287 aa  239  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  45.08 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  44.25 
 
 
302 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.8 
 
 
272 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.25 
 
 
303 aa  235  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.17 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  41.5 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.44 
 
 
270 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  47.16 
 
 
288 aa  229  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  45.39 
 
 
415 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  44.44 
 
 
278 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.97 
 
 
471 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  42.55 
 
 
278 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  43.64 
 
 
341 aa  223  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.98 
 
 
266 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.96 
 
 
361 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  45.9 
 
 
296 aa  218  7e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  41.6 
 
 
280 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.36 
 
 
293 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  41.83 
 
 
265 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.02 
 
 
291 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  42.75 
 
 
347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  41.05 
 
 
358 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  41.05 
 
 
358 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  43.68 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  44.05 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  41.11 
 
 
336 aa  215  8e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  44.57 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  45.71 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.86 
 
 
358 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.58 
 
 
358 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  45.8 
 
 
296 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.32 
 
 
348 aa  210  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  42.46 
 
 
351 aa  209  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.9 
 
 
247 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  42.91 
 
 
345 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  41.18 
 
 
357 aa  205  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  39 
 
 
349 aa  205  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  39.15 
 
 
281 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.06 
 
 
269 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.67 
 
 
247 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.19 
 
 
361 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.5 
 
 
353 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  45.3 
 
 
285 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.5 
 
 
353 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
363 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  42 
 
 
374 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.25 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  43.55 
 
 
363 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  40.61 
 
 
302 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  42.75 
 
 
384 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  39.39 
 
 
347 aa  198  9e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  47.21 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  43.75 
 
 
379 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  44.35 
 
 
363 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  40.4 
 
 
357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  38.58 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  43.75 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.85 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  41.96 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  41.53 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  40.4 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  44.4 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  38.87 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.53 
 
 
375 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  46.35 
 
 
361 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  42.8 
 
 
374 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  46.35 
 
 
361 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  40.89 
 
 
286 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  39.92 
 
 
364 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  46.35 
 
 
361 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  40.31 
 
 
279 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  41.13 
 
 
365 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  41.2 
 
 
374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>