More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3613 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  58.78 
 
 
291 aa  330  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  52.11 
 
 
295 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  55.24 
 
 
286 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.71 
 
 
288 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.97 
 
 
295 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  49.11 
 
 
302 aa  288  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  54.23 
 
 
296 aa  288  9e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  50.37 
 
 
304 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50.54 
 
 
471 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  52.65 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.36 
 
 
303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  48.12 
 
 
298 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  47.35 
 
 
415 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
308 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  50.61 
 
 
285 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  48.13 
 
 
297 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
317 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  48.51 
 
 
401 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  46.64 
 
 
416 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  50 
 
 
293 aa  255  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  48.24 
 
 
278 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  48.81 
 
 
301 aa  249  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  47.62 
 
 
297 aa  248  9e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  45.77 
 
 
272 aa  247  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  44.71 
 
 
341 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.31 
 
 
293 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  48.21 
 
 
285 aa  245  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.52 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  46.9 
 
 
288 aa  241  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  44.56 
 
 
290 aa  241  9e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  47.22 
 
 
297 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  48.18 
 
 
284 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  44.44 
 
 
302 aa  240  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  46.36 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  43.24 
 
 
265 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  44.53 
 
 
278 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.58 
 
 
270 aa  235  8e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.55 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.02 
 
 
289 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.41 
 
 
289 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.24 
 
 
289 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  45.11 
 
 
330 aa  229  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  40.96 
 
 
336 aa  229  5e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.83 
 
 
289 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  44.05 
 
 
269 aa  225  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  46.47 
 
 
281 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  50 
 
 
280 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  45.98 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  47.79 
 
 
277 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  47.26 
 
 
373 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  41.34 
 
 
302 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.05 
 
 
269 aa  218  8.999999999999998e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.55 
 
 
291 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1718  hypothetical protein  42.98 
 
 
310 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
348 aa  216  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  49.33 
 
 
358 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  49.33 
 
 
358 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  45.99 
 
 
375 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  44.64 
 
 
357 aa  215  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  46.15 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  45.57 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.86 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  47.13 
 
 
331 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  43.36 
 
 
281 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  44.03 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  43.84 
 
 
360 aa  211  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.66 
 
 
395 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.53 
 
 
247 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  43.18 
 
 
279 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.81 
 
 
358 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  40.48 
 
 
349 aa  211  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  47.58 
 
 
364 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  42.68 
 
 
347 aa  210  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.8 
 
 
367 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  42.13 
 
 
372 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  45.26 
 
 
307 aa  209  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  44.87 
 
 
372 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  42.86 
 
 
370 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0041  hypothetical protein  42.08 
 
 
304 aa  208  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0118047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  45.42 
 
 
394 aa  208  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.84 
 
 
298 aa  208  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  42.25 
 
 
371 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  46.12 
 
 
360 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  44.26 
 
 
351 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  42.4 
 
 
279 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.91 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.73 
 
 
415 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  44.54 
 
 
382 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  40.67 
 
 
361 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  43.88 
 
 
374 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  46.46 
 
 
304 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  41.76 
 
 
359 aa  205  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.31 
 
 
247 aa  205  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.9 
 
 
363 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0044  hypothetical protein  40.67 
 
 
308 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  42.42 
 
 
382 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  43.09 
 
 
296 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.55 
 
 
357 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.36 
 
 
363 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>