55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03351 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03351  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  852    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  56.9 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  42.16 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  32.61 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0600  hypothetical protein  23.29 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0259  hypothetical protein  22.95 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000795988  decreased coverage  0.0000000225048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0683  hypothetical protein  22.95 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  21.74 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  25.86 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  23.66 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.05 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  23.31 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  22.69 
 
 		 580 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  25 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  21.89 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  28.49 
 
 		 264 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  23.02 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  21.66 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.83 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  21.53 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  22.07 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  21.51 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  22.68 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  23.48 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  25 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 587 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  24.56 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.9 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  21.74 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.31 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  23.75 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  21.29 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  20.67 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.31 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0073  ParaA family ATPase  25.55 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  24.57 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.93 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  26.47 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  23.58 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  25.9 
 
 		 272 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  22.97 
 
 		 269 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  20.7 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.29 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  20.65 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  23.67 
 
 		 277 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>